我國地域遼闊，生態環境豐富多彩，鱘形目魚類的種類和數量都比較豐富，分布范圍廣泛，北自黑龍江、額爾齊斯河，南到珠江，以及我國沿海大部分近岸海區都曾有過它們的分布記錄，只是隨著緯度的降低，其種類和數量都略有減少。
據1834年的有關文獻記裁，中華鱘的模式產地是中國。盡管它不是中國特產，但卻由于模式產地在中國而出名。后來有人根據當時的中國歷史和后人的工作推測是廣州。它的分布較廣，在我國的渤海的大連沿岸、旅順、遼東灣、遼河；黃河北部遼寧省海洋島及中朝界河鴨綠江；山東石島、黃河、長江、錢塘江、寧波、甌江、閩江、臺灣基雄及珠江水系等。在長江可達金沙江下游；在珠江水系可上溯西江三水封開，北江達乳源，甚至達廣西潯江、郁江、柳江；在海南省沿岸亦產。國外見于朝鮮漢江口及麗江和日本九州西側。
現在中華鱘主要分布于我國長江干流金沙江以下至入海河口，其他水系如贛江、湘江、閩江、錢塘江和珠江水系均偶有出現。
